中心设置“灌区水土资源优化配置与优化调度”、“高效灌排技术与智能化装备研究”、“农田面源污染监测、防控与修复技术体系研究”和“稻田固碳减排与碳交易”四个方向团队。

       灌区水土资源优化配置与优化调度团队主要研发构建适用性强、功能完善的灌区水土资源多尺度调控优化管理系统，并开展实际应用、技术转让与孵化。团队由缴锡云教授牵头，共15名成员，其中教授6名、副教授5名

       高效灌排技术与智能化装备研究团队主要研发田间及作物多源信息共享平台、水肥一体化智能控制等关键技术及装备，实现以水肥管理决策为核心的监测-决策-智能控制的系统化集成解决方案，实现成果转化与推广应用。团队由朱成立教授牵头，共14名成员，其中教授5名、副教授5名。

       防控与修复技术体系研究团队主要针对平原河网和丘陵山区不同流域，研发有效的面源污染修复技术，开发构建智能化农业面源污染监测-预警-调控平台，并进行推广应用。团队由杨士红教授牵头，共14名成员，其中教授5名、副教授4名。

       稻田固碳减排与碳交易团队主要提出配套优化的水碳氮管理技术模式，构建适宜的作物-植被固碳减排生态模式，构建农田碳排放核算体系，开展相关产业碳减排成本、碳购买意愿、碳支付意愿的调查研究，支撑并引领全国农田碳交易市场和碳补偿机制的推进，助力农业绿色可持续发展与双碳目标实现。团队由徐俊增教授牵头，共13名成员，其中教授3名、副教授7名。